分公司不是独立法人，由总公司向工商局申请设立。是否签协议是公司内部管理问题。

分公司不是独立法人，由总公司向工商局申请设立。是否签协议是公司内部管理问题。

分公司是指公司在其住所以外设立的从事经营活动的机构。分公司不具有企业法人资格。自主经营，自负盈亏，一切法律责任由分公司个人负责，不符合分公司是公司在住所外设立的经营场所的法律特征，不予登记。如果已经登记，则按照“采取其他欺诈手段隐瞒重要事实取得公司登记的”的行为进行处罚；情节严重的，撤销分公司登记或者吊销营业执照。无论怎么签订协议都必须遵守以上原则的。

一、根据《中华人民共和国公司法》、《公司登记管理条例》、《深圳经济特区有限责任公司条例》及《实施细则》 等法律、法规的规定，有限公司可以依法设立分公司。 二、办理程序 1、凭公司《企业法人营业执照》； 2、备齐有关表格文件证件、申请营业设立登记； 3、 领取《营业登记》。 三、办理条件 1、公司法定代表人签署的《分公司设立登记申请书》； 2、公司章程影本； 3、由公司登记机关加盖印章的《企业法人营业执照》影本； 4、分公司负责人的任职文件原件及身份证明影本（任职档须盖公司公章及法定代表人签名）； 5、营业场所使用证明（营业场所为租赁的，提交房屋租赁合同原件和房屋产权影本，或者经租赁管理部门登记盖章的租赁合同原件；营业场所为公司或者股东自有的，提交房屋产权证明以及公司或者股东提供给分公司使用的证明）； 6、从事加工、生产项目，生产经营易燃、易爆、危险品的，申办娱乐服务场所、旅业、印刷等行业的，须提交分公司所在地工商所出具的《企业场地调查情况表》； 7、法律、行政法规规定设立分公司必须报经审批或者分公司经营范围中有法律、行政法规规定必须报经审批的项目的，还应提交有关的批准文件； 8、公司登记机关要求提交的其它档； 9、以上材料一式一份，未指明为影本的应当提交原件，指明为影本的应当提供原件核对（负责人的身份证明影本除外）。

分公司的设立在法律上是有规定的，如有需要请详细咨询或委托律师办理。